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揭示個體癌症Ce必發網娛樂城如何對藥物做出反應

今天在科學上報導的一項新技術克台湾六合彩服了對細胞樣品進行的典型高通量化學篩選的一些限制。這種屏幕通常用於嘗試發現新的抗癌藥物,並用於許多其他生物醫學應用中。

目前大多數具有這種性質的屏幕要么提供粗略的讀數(例如細胞存活率,增殖或大樂透開獎直播細胞形狀的變化),要么僅提供特定的分子發現(例如測試是否存在特定的酶)娛樂城註冊送yme被阻止。

由於這些極端情況之間存在巨大差距,因此大多數測定通常會遺漏微妙的基因表達或細胞狀態變化,從而可能揭示受擾細胞內部觸發的機制。此類測定法也可能無法檢測到細微差別,這些細微差別可能表明所測試藥物的意外副作用,或者基因相同的細胞對同一藥物的反應不同,或者為什麼細胞對以前有效的治療產生抗性。為了解決這些局限性,代表許多領域的研究團隊合作開發了更多信息技術。

華盛頓大學醫學院醫學科學家培訓計劃的醫學博士/博士生Sanjay R. Srivatsan說:“這項技術實際上在兩種常見的分析方法之間佔據了一席之地。”在西雅圖。“您可以對細胞反應有一種整體的看法。例如,我們認為對藥物進行分類並說出其作用機理將非常有力。”

這項新技術結合了標記細胞核的改進與分析什麼的進展iwin娛樂城 基因在數百萬個細胞的每一個中表達。這是在單細胞分辨率下以經濟有效的方式完成的。他們將新的篩選方法命名為sci-Plex。

在12月5日的《科學》在線版中,研究人員報告了他們的概念驗證發現。除Srivatsan之外,該論文的主要作者是威斯康星大學醫學院基因組科學的博士後研究員JoséL.McFaline-Figueroa;還有539連碰算法前UW基因組科學研究生的Vijay Ramani,現在是加利福尼亞大學的桑德勒學院院士。

資深研究員是西澳大學醫學院基因組科學副教授,西雅圖布羅特曼·巴蒂精密醫學研究所的研究員科爾·特拉普內爾(Cole Trapnell)和西密西根大學醫學院的基因組科學教授兼布羅特曼·巴蒂研究所科學主任傑伊·申杜爾Shendure還是霍華德·休斯醫學研究所(Howard Hughes Medical Institute)的研究員,並領導UW Medicine艾倫研究所細胞譜系追踪發現中心。

“ sci-Plex技術使我們能夠匯集許多遺傳差異金好贏娛樂城錯誤的細胞,並觀察許多單個細胞以多種不同方式受到干擾時會發生什麼。” Trapnell說。 “然後我們將所有數據收集在一起,並使用來自機器學習和數據科學的現代工具進行分析,以了解每種藥物對細胞的作用。​​”

為了使sci-Plex步入正軌,研究人員將其應用於三種癌細胞系(白血病,肺癌和乳腺癌)的篩查中,這些癌細胞係經過180種化合物的治療,可用於癌症,HIV和自身免疫性疾病治療。細胞用小的單鏈DNA的核哈希標記。這種哈希識別不同的細胞,並允許科學家繪製出哪些細胞接受了哪種藥物的圖譜。在僅一項實驗中,研究人員測量了來自5,000多個獨立處理樣品的650,000個單細胞中的基因表達。

結果表明某些癌細胞對特定化合物的反應方式存在顯著差異。他們還揭示了細胞之間關於其他化學家族的共同模式以及區分化學家族中藥物的某些特性。研究人員更深入地研究了一種癌症藥物HDAC抑製劑的作用方式。他們發現,基因調控的變化與這些抑製劑通過阻止獲取能量來阻止癌細胞增殖的主張相符。

描述另一個規格真人娛樂城Srivistan說:“這項研究很酷,我們可以使用基因表達譜對藥物的功效進行分類。隨著劑量變化超過四個數量級,我們可以看到細胞反應的平穩增加。”

總體而言,sci-Plex研究表明,它可以按比例縮放到成千上萬個樣品,以靶向多種生化途徑,催化劑,調節劑和作用方式。

Trapnell說:“其中一些工作可能與疾病的治療有關,可以幫助醫學研究人員了解某些藥物如何產生作用,細胞階段如何影響功效以及為什麼某些藥物對某些細胞起作用而對其他細胞不起作用。”

“醫師還給許多人同樣的少數藥物,他們為某些人而不是其他人工作,” T財神娛樂城rapnell添加了。 “潛在的sci-Plex可以幫助我們更好地理解為什麼會這樣。”

Trapnell表示,他相信sci-Plex可能是精密醫學的有用工具:“最終,當某人患了癌症時,我們希望殺死整個腫瘤,所有細胞,而不僅僅是一些細胞。因此,了解為什麼某些單個細胞對藥物的反應方式不同而另一些細胞對藥物的反應方式卻不同,對於設計出完全有效的療法至關重要。”

研究人員指出,sci-Plex的獨特優勢在於它可以區分化合物如何影響細胞亞群。除了構成腫瘤的那些,這些子集還可以包括實驗室培養皿活體模型,例如重新編程的細胞,類器官和合成胚胎。

研究人員認為,核哈希的簡便性和低成本以及其單細胞測序方法的靈活性和可擴展性,可以為sci-Plex提供許多在生物醫學方面的基礎研究和實際應用。例如,它可能有助於建立細胞對藥物干預反應的綜合圖集。

“這是一個非常普遍的策略,” Srivatsan說。 “它可以與任何科學家都能獲得的試劑一起使用,並且可以以多種方式使用。”

特拉普內爾同意了。 “我對單細胞基因組科學界如何為我們未曾預料到的事情感到高興。在我們領域,這種情況一直存在。技術開發人員和實驗生物學家正在以原始開發人員未想到的各種方式重新利用技術。”

參考:Srivatsan, (2019)在單細胞分辨率下大規模復用化學轉錄組學。 科學 DOI:10.1126 / science.aax6234

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