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模型識別細菌元基因組肛門的偏差

北卡羅萊納州立大學的研究人員開發了一個數學模型,該模型顯示了偏差分佈如何新天下娛樂城大樂透玩法過宏基因組測序測量細菌群落時電競運彩下注的結果。概念驗證模型可能是邁向開發的第一步真人娛樂城可以使宏基因組學測量更準確的定標方法。

元基因組測序通過從樣本中提取DNA來鑑定特定群落中(例如,人類腸道微生物組中)細菌的數量和類型。人口健康與病理生物學助理教授,描述這項工作的論文的相應作者本·卡拉漢說:“我們正在測量細菌群落-存在的細菌以及每種細菌的數量。” “但是,測量技術並不完美,這會給結果帶來偏差。這意味著我們無法準確了解我們要衡量的社區。”

據卡拉漢說,由於宏基因組測序是一個多步驟的過程,因此在每個娛樂城賺錢tep。

卡拉漢說:“最著名的步驟是DNA提取,我們在其中打開細菌以獲取DNA。” “某些細菌的細胞比其他細菌更難分解。假設我的細菌佔一半tha娛樂城 社區,但表現不佳。在我的測量中,我最終只能得到該細菌的10%,而不是實際存在的50%。這帶來了偏見。現在,從那時起,我所做的每項測量或計算都會系統地傾斜。”

Callahan與華盛頓州立大學博士後研究員Michael McLaren和華盛頓大學生物統計學家Amy Willis一起,在已知組成的微生物群落中測試了他們對兩種宏基因組測序(16S RNA基因和shot彈槍宏基因組學)的偏見模型,並發現了該模型在這些情況下準確描述了偏改善偏財運見。

“這項實驗表明,我們提出的模型至少可以在這些有限的情況下起作用,”卡拉漢說。 “長期目標是為複雜的自然群落的宏基因組學測量提供校準工具,就像我們擁有用於校準測量技術的標準一樣,例如秤,示波器和顯微鏡。這項工作是朝著這一目標邁出的第一步。”

參考
宏基因組測序實驗中一致且可糾正的偏倚。 Michael R McLaren,Amy D Willis,Benjamin J Callahan。 eLife,2019; 8:e46923 DOI:10.7554 / eLife.46923。

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