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研究人員對330棵帝禾娛樂城的老楊樹進行表觀遺傳分析

與遺傳突變相似,表觀遺傳變化,即未在一級DNA序列上發生的基因修飾,有時會偶然地在植物中產生,並可以世代傳播。現在,以樹木為模型,研究人員首次表明,這些所謂的外顯子在植物的整個發育過程中不斷累積,它們可以用作分子鐘來估計樹木的年齡。

表觀遺傳標記不會改變DNA序列,但會影響基因的活性。 “儘管在動物(包括人類)中,這些標記被認為在配子,植物中已完全重置,但它們可以在動物體內穩定存在。94大發網世代相傳。”慕尼黑工業大學(TUM)的人口表觀遺傳學和表觀基因組學教授Frank Johannes說道,他的研究團隊一直在試圖了解植物基因組中基因突變的產生方式,它們在各代中的穩定性如何以及是否它們會影響重要的植物特性。

樹木是自然的mut積積累系統

“由於樹木的超長壽命,它們可以作為自然的mut積積累系統,因此在發發網約翰內斯教授說。他與共同作者之一,美國佐治亞大學的Robert J. Schmitz教授(也是TUM-IAS的漢斯·費舍爾研究員)一起,最近發表了兩篇與此主題相關的論文。

在他們的研究中,研究小組專注於一棵擁有330年曆史的楊樹。通過比較樹木不同分支的葉子的DNA甲基化(重要的表觀遺傳標記),他們能夠證明表位變異隨樹齡的增長而不斷累積。研究人員發現,兩葉之間的距離越遠,就發育時間而言,它們的DNA甲基化模式越相似。據此,研究人員能夠得出結論,體細胞外顯子突變率比同一棵樹中的基因突變率高約10,000倍。

樹上的表觀遺傳時鐘?

這一發現引出了一個有趣的見解,即表位變異可以用作確定樹木年齡的一種分子鐘。 “只有一些樹枝是通過計算年輪來確定日期的,但不幸的是不是主要莖。我們確實需要這些信息來進行分析,因此我們決定將樹的總年齡作為未知參數,並讓葉子的DNA甲基化數據告訴我們樹的年齡。這估計約為330年。”約翰尼斯教授說。

後來的估計結果與主莖的基於直徑的測年以及有關該特定樹的生活史的其他信息相一致。 “這是樹上出現表觀遺傳時鐘的第一個跡象。”

過去的一扇窗

約翰內斯教授周圍的研究小組正在研究這樣一個問題,即樹木在其長壽命期內是否會經歷環境變化?娛樂城賺錢我留下了表觀遺傳學的特徵,這些特徵可以被閱讀和解釋以了解他們的過去。

“我們的目標是整合 i88娛樂城我們的表觀遺傳工作獲得的歷史環境數據。我們認為,這可能為過去提供了一個窗口,可以幫助我們了解樹木如何應對特定的環境挑戰,例如乾旱和溫度波動。在考慮未來時,尤其是考慮到全球氣候變化時,此類信息可能會有​​用。”

參考:Shahryary Y,Symeonidi A,Hazarika RR等。 AlphaBeta:從植物的高通量DNA甲基化數據計算表觀突變率和光譜。基因組生物學。 2020; 21(260)。 doi:10.1186 / s13059-020-02161-6

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