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算法尋找基因表達娛樂城註冊送遞數據中的異常

卡內基梅隆大學的計算生物學家已經設計出一種算法,可以快速分類大量的基因表達數據,以發現可能值得進一步研究的意外現象。此外,該算法然後重新檢查其自身的輸出,查找它所犯的錯誤,然後進行糾正。

汽車的這項工作皇璽會娛樂城l金斯福德大學(CMU)計算生物學系教授,馬聰(Cong Ma)博士。計算生物學專業的學生,是首次嘗試自動搜索由RNA測序或RNA-seq(推斷基因活性水平的主要方法)推斷的基因表達中的異常情況。

研究人員報告說,他們已經在兩個普遍使用且以前未知的廣泛使用的RNA-seq文庫中檢測到88個異常-基因中區域的表達異常高或低。

金斯福德說:“我們還不知道為什麼會看到這88種奇怪的圖案,”他指出,它們可能會成為進一步調查的對象。

儘管有機體的遺傳構成是靜態的,但基因的活性水平或表達隨時間變化很大。因此,基因表達分析線上真人麻將推薦已成為生物學研究以及診斷和監測癌症的主要工具。

異常可能是研究人員的重要線索,但直到現在發現它們一直是痛苦的94大發網-娛樂城推薦國王,手工程序,有時也稱為“順序注視”。金斯福德說,要發現一個異常可能需要檢查20萬個轉錄物序列,即編碼基因DNA信息的RNA序列。因此,大多數研究人員將他們認為重要的基因區域歸零,而忽略了絕大多數潛在的異常現象。

Ma和Kingsford開發電競運彩怎麼買的算法可自動搜索異常,使研究人員可以考慮所有轉錄本序列,而不僅是他們希望看到異常的區域。這項技術可以發現許多新現象,例如在多組織RNA-seq台灣六合彩玩法文庫中發現的88個以前未知的常見異常。

但是馬雲指出必發網帽子識別異常通常不明確。例如,某些RNA序列的“讀”對於多個基因和轉錄本是共有的,有時會被定位到錯誤的序列。如果發生這種情況,一個遺傳區域可能會比預期的活躍程度更高。因此,該算法會重新檢查它檢測到的任何異常,並查看它們是否娛樂城廣告當RNA-seq讀數在基因之間重新分佈時,出現。

馬雲說:“通過在可能的情況下糾正異常,我們減少了錯誤預測差異表達實例的數量。”

參考

馬和金斯福德。 (2019)檢測,分類和糾正RNA-Seq量化的覆蓋範圍異常。 細胞系統DOI:https://doi.org/10.1016/j.cels.2019.10.005

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