對青少年患者的全面臨床基因組學測試，包括全基因組測序，幫助研究人員識別出驅動最常見的兒童黑色素瘤的單個基因突變。聖裘德兒童研究醫院的研究今天作為高級在線出版物發表在該雜誌上 自然醫學娛樂城比較藥。
進一步的研究發現，在這項研究中篩選出的33％的年輕人患有類扁平狀黑色素瘤，在同一基因MAP3K8中攜帶了新的突變，包括重排。模擬量帝禾娛樂城在接受測試的近500名成年黑色素瘤患者中，有1.5％也發現了突變。 Spitzoid黑色素瘤發生在兒童和成人中，但它是最常見的小兒黑色素瘤。
研究人員還報告了具有MAP3K8突變的患者可能成為精密藥物候選人的證據。該研究的最初患者對精準藥物的反應短暫，該精準藥物針對的是被MAP3K8突變的基因。
“這項研究表明，全捕魚達人千砲版基因組和全轉錄組測序可以揭示流行的使用基因面板的商業篩選測試所遺漏的驅動子突變，”聖裘德計算生物學系主席張靜輝博士說。這些新發現的改變，包括基因融合，有可能影響治療。”
通訊作者為聖裘德計算生物學系的斯科特·紐曼（Scott Newman）博士和聖裘德病理學系的準成員阿米塔·巴赫拉米（Armita Bahrami），醫學博士。紐曼也是第一作者。
這種病
今年，在美國將診斷出約96,480例黑色素瘤病例，其中1％至2％發生在兒童和青少年中。 Spitzoid黑色素瘤的範圍很廣，從緩慢生長的痣到侵襲性腫瘤。然而，在大約50％的病例中，未知驅動腫瘤的突變。這些結果表明電競運彩賠率，MAP3K8是小兒Spitzoid黑色素瘤中最常見的突變基因。
發現
MAP3K8是一種致癌基因，通過聖裘德的研究《兒童基因組》引發了類扁平狀黑色素瘤。該研究包括患者腫瘤和正常組織的全基因組，全外顯子組和全轉錄組測序。
全基因組測序確定構成人類DNA的30億個化學鹼基的確切順序，該分子編碼組裝和維持生命的指令。外顯子組占基因組的1％至2％，並帶有蛋白質組裝說明。轉錄組識別正在表達的基因。
對來自最初患者的遺傳物質進行測序和分析表明，這些改變包括CDKN2A / B基因的缺失和TERT基因的突變，已知該基因可導致類扁平狀黑色素瘤。但是故事還不完整。
Bahrami說：“激酶基因融合體通常是spitzoid黑色素瘤的起因。”正在分析此案的紐曼補充說：“該腫瘤沒有攜帶以前與黑色素瘤有關的激酶突變。”激酶是充當“開/關”開關以調節其他蛋白質活性的酶。
紐曼將注意力轉向測序揭示的數十種其他重排和其他突變，包括激酶MAP3K8融合時產生的新融合基因娛樂城廣告 與另一個基因的一部分。
紐曼說：“擁有全基因組和全轉錄組數據都是必不可少的。” “它幫助我們確定了基因重排，並確定了新的功能博馬娛樂城sion基因正在被翻譯成功能蛋白。”
已知MAP3K8調節MEK，MEK是一種促進細胞分裂的基因，在其他癌症中也被放鬆調節。科學文獻檢索發現先前發表的地下539坐車研究表明MAP3K8在黑色素瘤中可能發揮作用。
這些發現導致了曲美替尼的治療，這是一種抑制MEK蛋白的精密藥物。在對MEK抑製劑產生初步陽性反應後，當其明顯停止工作並且患者出現副作用時，終止治療。
當在聖裘德的另一名患有類扁平狀黑色素瘤的患者中發現另一個新的MAP3K8突變時，研究人員將其分析範圍擴大到包括49名患者的類扁平狀腫瘤。篩查發現33％的患者攜帶MAP3K8突變。研究小組預測，他們發現的不同的MAP3K8突變都會導致MAP3K8過度活躍，並繼續激活MEK。
紐曼和他的同事在《癌症基因組圖譜》中挖掘了轉錄組測序數據，令他們驚訝的是，在472名成年的黑色素瘤患者中，有1.5％攜帶了類似的MAP3K8突變。
下一步
研究人員指出，這些發現凸顯了針對曲美替尼和其他精準藥物的臨床試驗的需要，這些藥物針對這項研究中確定的改變。有證據表明患者對藥物產生了耐藥性。
Bahrami說：“此外，這項研究表明，MAP3K8將來應該被納入癌症基因組研究中。”
研究數據，包括來自初始患者的全面測序數據，可在St. Jude Cloud中獲得。
本文已從聖裘德兒童研究醫院提供的材料中重新發布。注意：材料的長度和內容可能已被編輯。有關更多信息，請聯繫引用的來源。
參考：Scott Newman， 等。 臨床基因組測序發現了可能在Spitzoid和其他黑色素瘤中MAP3K8的目標截斷和融合。 自然醫學 （2019）DOI：https：//doi.org/10.1038/s41591-019-0373-y&娛樂城pttnbsp;
