用於個性化抗生素治療的全基因組測序信用卡娛樂城

約翰霍普金斯大學醫學院的研究人員說,他們已經增加了證據,即快速抗性基因測序技術可以準確地加快識別會致死並殺死某些患者的特定抗藥性細菌菌株的速度。有關概念驗證研究的報告,於2019年1月發布信用卡娛樂城 問題在於 抗菌劑和化學療法。 ,表明該技術有可能加快重症患者所需抗生素妞妞算牌的“個性化”選擇。

約翰·霍普金斯兒童中心兒科副教授,研究作者之一,醫學博士Pranita Tamma說:“開具有效的抗生素治療耐藥性感染的處方會增加不良後果的風險。” “從實驗室收到樣品開始,當前針對高耐藥菌識別適當治療方案的標準過程可能要花費96個小時,但我們的發現表明,使用快速的全基因組測序方法,我們可能會減少時間減少了大約一天。” Tamma補充道。

Tamma指出,耐藥性細菌感染正在急劇增加,這在很大程度上是由於抗生素藥物的過度使用,部分原因是細菌可以輕鬆地從其他細菌菌株或物種中獲得新的抗性基因,尤其是在醫院環境中,不同的菌株可能會混合。正在進行開發新抗生素的工作娛樂城廣告是的,但受到限制,塔瑪說。

美國疾病控制和預防中心估計,每年至少有200萬人發展出抗藥性感染,並且至少有23,000人因此而死亡。當前,用於鑑定特定細菌菌株的典型實驗室測試需要24小時才能使從患者身上取樣的微生物培養物生長,另外需要24至48小時才能確定哪種常用的抗生素對其有效。對於對多種藥物具有耐藥性的細菌,進一步的測試可能還需要24至48小時以上的時間才能確定哪些最後的抗生素可以根除感染。

多年以來,科學家一直能夠篩選細菌基因組中特定的抗生素抗性基因,這是一個費力且耗時的過程,直到最近出現了能夠在數小時內對細菌基因組進行測序和分析的新技術。這些技術還提供了快速的方法來準確識別病原體所包含的抗性基因的類型。

Tamma和Patricia J. Simner博士(ABMM)在旨在測試此類方法概念驗證的研究中,該研電競運彩玩法究的資深作者,約翰·約翰遜大學病理學和醫學微生物學副教授霍普金斯大學醫學院使用了納米孔DNA測序儀,這是一種較新類型的技術,比起其他DNA測序工具,其產生結果的速度要快得多,因為當一串DNA穿過細孔(即納米孔)時,它可以測量電信號。實時監控電信號,可在數分鐘內分析測序結果。其他測序儀至少需要24小時才能進行結果分析。

研究人員使用新的測序儀在幾株肺炎克雷伯菌中發現了抗生素抗性基因,這些細菌可能無害地駐留在人的腸道中,但是如果它們進入血流,泌尿道或肺部,則可能引起嚴重的感染。儘管所有典型的肺炎克雷伯菌菌株都可以捕魚達人千砲版用常見的抗生素(例如頭孢曲松)進行治療,但那些獲得了抗藥性基因的細菌卻可能變得危險而致命。那些風險最高的人已入院,反復接觸抗生素或來自世界上以高抗生素耐藥率聞名的地區。

該團隊從約翰霍普金斯醫院住院的40名成年患者中收集了培養出肺炎克雷伯菌的臨床樣品,提取了細菌DNA,並將其通過納米孔測序儀進行分析。研究人員使用兩種不同的方法來發現抗生素抗性基因。一種實時分析方法可以讓研究人員在八個小時內梳理已經測序的基因組部分,同時仍在讀取其餘的DNA,從而揭示了抗性基因。基於組裝的方法花費了14個小時,但事實證明,該方法更加準確且不易出錯。實時方法正確識別了肺炎克雷伯菌耐藥基因和突變的比例為77%,基於裝配的比例為92%。

“儘管我們仍然需要等待24小時才能使培養物生長,但與我們目前的護理標準相比,我們能夠將識別有效抗生素療法的時間至少縮短了20小時,” Simner說。該團隊還相信,樣品製備的進一步自動化可以減少等待最佳療法的時間。

Tamma和Simner警告說,他們的研究並不意味著該技術已準備好用於臨床,或者將證明該技術更便宜或更具成本效益。

該研究受到樣本量小和僅一種細菌生物的限制。深度學習 必發網娛樂城需要與其他細菌一起測試新測序儀的價值,並且所應用的方法仍需要改進,使其易於在臨床環境中使用。

Tamma表示,他們的發現是對精確或個性化醫學承諾的合乎邏輯的結果,該醫學使用遺傳特異性來指導感染患者的治療, 台灣娛樂城癌症,心髒病和其他疾病。

本文已由John Hopkins Medicine提供的材料重新發表。注意:材料的長度和內容可能已被編輯。對於毛皮淘金娛樂城她的信息,請聯繫引用來源。

參考:Pranita D. Tamma,Funfan Fan,Yehudit Bergman,Geo Pertea,Abida Q. Kazmi,Shawna Lewis,Karen C. Carroll,Michael C. Schatz,溫斯頓·廷普,Patricia J. Simner。 2019.應用快速全基因組測序來預測耐卡巴培南的肺炎克雷伯菌臨床分離株的表型抗菌藥敏感性測試結果。抗菌劑和化學療法。 DOI:10.1128 / AAC.01923-18。