當研究人員說他們已經對人類基因組進行了測序時,這一說法有一個警告:許多人類基因組已經過測序和組裝,但是某些區域中充滿了重複性元素,因此很難繪製圖譜。眾所周知,很難測序的是Y染色體。
現在,羅切斯特大學的研究人員找到了一種對果蠅果蠅中大部分Y染色體進行測序的方法,這是Y染色體在果蠅中組裝而成的大部分。這項研究發表在雜誌上 遺傳學的研究為形成Y染色體的過程提供了新的見解,“並增加了證據,表明Y染色體遠離遺傳荒原,具有很高的動態性,並具有獲取和維持基因的機制,”該研究所的助理教授Amanda Larracuente說。羅切斯特生物學。
臭名昭著的Y染色體
Y染色體是男性中從父親傳給兒子的性染色體。在許多物種中,它們對於男性的生育能力和性別決定很重要。儘管果蠅和哺乳動物的Y染色體具有不同的進化起源,但它們具有平行的基因組九州娛樂城Larracuente與她的博士生Chang Ching-Ho Chang共同撰寫了這篇論文,他說:“這是一種結構”。 “ Drosop娛樂城推薦hila melanogaster是遺傳學和基因組學的主要模型生物,也許是所有動物捕魚達人外掛中基因地下運彩ptt組組裝最好的。儘管有這些資源,但我們對果蠅Y染色體的組織知之甚少,因為它在基因組組裝中丟失了很多。”
部分原因是大多數Y染色體未進行標準重組。通常,將母體和父親的基因改組(或“交叉”)以產生每個後代獨特的遺傳組合。但是,Y染色體不會發生交叉,因此,其基因趨於退化,而重複的DNA序列卻會積累。
排序VS。組裝
每個染色體都由DNA組成。在繪製基因組圖譜時,傳統的測序方法會切碎DNA鏈並讀取(或測序)它們,然後嘗試推斷這些序列的順序並將它們重新組裝在一起。
但是,“對基因組進行測序與對基因組進行組裝之間存在差異,”拉拉昆特說。 Y染色體上的重複鏈太多,碎片看起來往往相同。因此,很難弄清它們來自何處以及如何重新組裝線束-就像在所有塊都完全相同的顏色時試圖拼成一玩運彩個難題。 “當我們嘗試獲取這些DNA片段並組裝它們以觀察染色體的樣子時,我們無法填補其中的一些空白。我們可能擁有序列,但我們不知道它的去向。”
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Chang和Larracuente利用讀取單個DNA分子長鏈的新技術生成的序列數據,開發了一種組裝大部分Y染色體和其他密集區域的策略。通過組裝大部分Y染色體,他們發現Y染色體具有很多重複的序列,其中基因以多個副本存在。他們還發現,儘管 發發網-娛樂城Y染色體沒有交叉,它經歷了另一種類型的重組,即基因轉換。 Larracuente說,雖然跨越涉及兩個不同染色體之間基因的改組和交換,但是基因轉換並不是相互的。 “您沒有兩條交換材料的染色體,您只有一條染色體將其序列提供給染色體的另一部分”,這些序列變得相同。
Larracuente說,因此Y染色體找到了一種通過與雜交不同的過程來維持其基因的方法。 “我們通常認為Y染色體是一個基因生存的非常嚴酷的環境,但是這些基因設法表達並執行對男性生育至關重要的功能。這種猖gene的基因 娛樂城app我們看到的轉換是我們認為基因可能能夠在Y染色體上生存的一種方式。”
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參考:張清鎬和阿曼達·M·拉拉昆特。 2019.富含異染色質的裝配體揭示了果蠅Y染色體的序列和組織。 https://doi.org/10.1534/genetics.118.301765。