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28,000例腫瘤的信用卡娛樂城發現了568種癌症驅動基因

對來自66種癌症的28,000個腫瘤的基因組進行分析,已鑑定出568個癌症驅動基因。

由巴塞羅那IRB的生物醫學基因組學實驗室進行的這項研究對整合型腫瘤基因組學(IntOGen)平台進行了重大更新,旨在鑑定突變的癌症驅動基因。

出版於 自然評論巨蟹座,結果提供了迄今為止癌症驅動基因簡編的最完整快照。

癌症是一組疾病,其特徵在於突變和細胞基因組中的其他改變導致細胞生長不受控制。腫瘤可以出現數百至數千個突變,但只有少數幾個對其致瘤能力至關重要。這些關鍵突變影響癌症驅動基因的功能。尋找具有這種癌症驅動基因突變的基因是癌症研究的主要目標之一。

由ICREA研究人員NúriaLópez-Bigas領導的IRB巴塞羅那生物醫學基因組實驗室的研究人員對來自66種癌症的大約28,000個腫瘤進行了廣泛的計算分析,並確定了568個癌症驅動基因。這些關鍵基因在調節細胞生長,細胞週期和DNA複製等方面起特定作用。這些基因的突變賦予惡性細胞快速無休止地繁殖的能力,逃避免疫系統和其他防禦系統,擴散和侵襲其他組織,以及為其自身利益而改變環境。

López-Bigas說:“驅動基因簡編為臨床和基礎研究領域的癌症研究人員提供了至關重要的知識,並且對臨床決策具有重要影響。”她舉例說:“例如,如果我們知道腫瘤的致癌能力依賴於一種特定的蛋白質,那麼腫瘤學家可以採用經過批准的靶向療法,即抗體或其他阻礙其功能的抑製劑,來治療患者。”

大多數癌症驅動基因都很高娛樂城推薦特定於

通過鑑定568種癌症驅動基因,研究人員觀察到大多數基因具有高度特異性,並且它們的突變僅能觸發幾種腫瘤類型。但是,只有一小部分人,他們的用途非常廣泛,可以539大樂透中獎號碼查詢導致20多種不同類型的癌症,僅佔所確定人群的不到2%。 “儘管已知癌症驅動基因自首次被鑑定以來具有不同程度的特異性,但是有了該綱要的快照,我們就能夠以公正的方式解決這個問題,”生物醫學研究助理AbelGonzálezPerez說基因組學實驗室的負責人。

其他小組先前的研究表明,癌症是由癌症驅動基因中的平均4個關鍵突變引起的。某些類型的癌症具有少量突變,但在這些基因中僅出現一種突變,而其他通常表現出許多突變的癌症(例如結直腸癌和子宮腫瘤)最多可容納10種。其他基因組改變,例如結構變異,基因拷貝數的變化以及影響基因組非編碼區的突變也有助於腫瘤發生。

積極選擇作為指標

與預期的中性不同,基因中令人驚訝的突變模式構成了信號,表明它們在腫瘤發生中處於正選擇狀態。 IRB Barcelona研究人員使用這些陽性選擇信號來識別突變驅動基因。為了計算這些信號,需要針對所有基因準確地模擬中性下突變的積累,以便可以容易地發現任何基因與預期模式的差異。

用於鑑定突變驅動基六合彩即時因的陽性選擇信號例如是基因中異常大量的突變或突變捕魚達人交易沿基因序列的意外分佈。在發表在《自然評論巨蟹》雜誌上的最新文章中,研究人員介紹了開放獲取IntOGen平台的更新,包括跨所有突變驅動基因對這些信號計算的值。隨著越來越多的腫瘤測序數據越來越多,IntOGen平台為系統簡編提供了理想的基礎設施發發網-娛樂城進入公共領域,”冷杉說hoya娛樂城作者是生物醫學基因組學實驗室的博士後研究員FranciscoMartínez-Jiménez。

豐富癌症基因組解釋器

生物醫學基因組學實驗室先前開發了一個名為癌症基因組解釋器的平台,旨在支持腫瘤學的臨床決策。最近發布的每種癌症類型的驅動基因綱要及其在腫瘤中的突變模式,將為正在開發中的新版本的癌症基因組解釋器提供支持,從而提高其識別可能是個體腫瘤關鍵的突變的能力,並且構成治療劑新球網娛樂城ic目標。驅動基因綱要的快照以及用於生成驅動基因的計算系統可免費提供給臨床和基礎癌症研究人員,供其探索和下載。

參考

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Martínez-Jiménez等。 (2020)。突變癌症驅動基因的綱要。 自然評論巨蟹座DOI:https://doi.org/10.1038/s41568-020-0290-x

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