人類微生物組的探索

意大利特倫託大學的科學家發現並分析了人類中和人類上生活的大量以前未鑑定的細菌。這項計算宏基因組學研究出現在 細胞。

Segata博士解釋說:“我們對大量細菌和古細菌進行了基因鑑定和分類,這些細菌和古細菌是人類微生物組的一部分,但至今仍未得到探索,表徵和未描述。我們還觀察到,這些微生物中的許多往往很少在Westerni中確定淘金娛樂城人口,很可能是複雜的工業化進程的間接結果”。

與其他539中二合多少錢生物類似,微生物會隨著環境(包括飲食和生活方式)的變化而進化並承受選擇壓力。在某些情況下,對我們的健康至關重要的人類相關微生物處於滅絕的危險中。研究小組調查了其中一些案例。提出的研究內容金好贏娛樂城處理基因組學,微生物學和大數據,並聘請了特倫託大學CIBIO系的幾位研究人員以及s定量和計算生物學碩士課程的學生539二三四星連碰多少錢娛樂城賺錢阿美研究所。該研究還涉及哈佛大學(美國)和馬達加斯加(新西蘭),西班牙國家研究委員會(瓦倫西亞)和沃里克大學(英國)負責微生物群抽樣的合作夥伴。

Nicola Segata將研究重點放在人類微生物組上。他解釋說:“這是細菌,古細菌,病毒,真菌和寄生蟲的集合,這些細菌,細菌,古細菌,口腔,皮膚和泌尿生殖道等人體部位遍布其中。人類微生物組與我們自己的細胞和細菌共生。它對我們的健康起著關鍵作用,例如在飲食化合物的新陳代謝,調節所謂的腸腦軸,保護我們免受病原體的侵害以及調節我們的免疫系統等方面。微生物組與某些癌症的病因和抗腫瘤免疫治療方法的成功有關”。

他的團隊研究人類微生物組的方法稱為“計算宏基因組學”:他們通過分析其遺傳信息來研究微生物組。他們從一滴唾液,皮膚拭子或一克糞便中提取樣品中微生物的總DNA,然後將它們娛樂城將DNA用於高通量測序。使用專門的軟件分析生成的大量遺傳數據,以重建微生物組中存在的微生物的基因組。

Segata博士詳細介紹了這項新研究的一些方面:“我們的發現是CIBIO的一個多學科團隊的結果,該團隊由微生物學家,統計學家和計算機科學家組成,他們確定了將近5,000種微生物,概括了超過154,000種描述人類微生物組的新重建基因組。跨年齡,身體部位,生活方式和疾病。我們每個人都被數百個這樣的物種定居,但其中很大一部分(77%)以前是未知的。在世界範圍內的人口中,他們的發現是測試其在自身免疫,胃腸道和腫瘤疾病中潛在作用的起點,為獲得這些結果,我們分析了一個非常龐大的數據集,這些數據集涵蓋了地理,人群生活方式的公共和新近獲得的微生物組樣本總的來說,我們考慮了使用DNA研究的9,428個人類微生物組樣本測序技術稱為宏基因組學”。

這項研究的合作者,哈佛大學的Curtis Huttenhower博士陳公共衛生學院評論說:“對於人類微生物組的大量研究已經開始對理解人群健康特別重要。關於微生物組的一個令人驚訝的發現是它的個性化程度和詳細程度了解其對每個人健康的影響所必需的技術,例如本研究開發的技術,具有識別每個人獨特的新微生物以及這些微生物獨特的基因和分子的能力,這些微生物又可以進行免疫信號傳遞或修飾我們在這項工作中發現瞭如此驚人的差異,這一事實也說明了微生物組與全球健康的關係-例如,在解釋對疫苗的反應中的某些差異時,可能歸因於微生物而不是微生物。而不是人類的遺傳多樣性。”

在發現並分析其中一種細菌時,Segata繼續說道:“我們將最常見的先前未知的候選物種稱為 彎孢桿菌,是全球人口中第七大最普遍的人類相關微生物。我們通過重建1800多個基因組對其進行了研究。我們認為該物種可能與進一步了解人類微生物組的功能特別相關。”

最後一個關於人類之間觀察到的差異的亮點是:“我們特別關注了無法獲得高脂飲食,包括抗生素在內的普通藥物並且沒有在高度衛生的環境中生活的非西方化人群。發現了許多新型微生物在整個大洲的非西化種群中,幾乎沒有發現西化種群,因此,我們的工作使這種微生物物種的研究成為可能,這些微生物物種將來可能與自噬的發病率增加相關娛樂城app在西方化的人群中感染各種疾病,過敏和復雜的綜合症。因此,至關重要的是分離,培育和維持這改善偏財運些物種,這些物種可以通過新穎的干預策略假想地重新引入西化種群。” 

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參考:Pasolli等。 2019.廣泛的未開發人類微生物組多樣性揭示了跨越年齡,地理和生活方式的超基因組的150,000個基因組。細胞。 DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.01.001。