Stowers醫學研究所的研究人員創造了一種新穎的方法，可以快速，高效且信息豐富的方式定義單個蛋白質的締合。這些發現發表在《自然通訊》上，展示了Stowers研究人員創建的拓撲評分（TopS）算法如何通過組合數據集來識別結合在一起的蛋白質。
的94大發網 這種方法類似於查看社區中所有個體的活動和互動，然後選擇最有意義的互動，其中一些互動非常罕見。研究人員正在尋找兩個個體的生物學等價物，他們可能是整個社區中唯一參與重要互動的兩個人。
這不僅有助於研究人員確定蛋白質如何執行生物學功能或執行生物學過程，而且該算法可以應用於先前生成的生物學數據以及潛在的其他科學領域，以收集新信息。
Stowers蛋白質組學中心主任Michael Washburn博士說：“這是大數據分析的一種形式，我們將其應用於蛋白質組學數據以識別和理解蛋白質相互作用網絡。” “它是對許多技術的補充發發網-娛樂城已經使用，因此可以用來提問和回答新問題。”
地下539公式由於蛋白質數據集非常大，因此難以檢查有意義的信息。 “您需要查看數千種蛋白質，” Stowers的高級研究專家Mihaela Sardiu博士說。了解各種各樣的蛋白質如何共同完成某事，例如修復DNA，是一個難題。 “我們想簡化問題。”
這意味著他們沒有全面了解所有事物，而是尋找不太常見的事件。研究人員通過尋找誘餌（已知與目標過程有關的蛋白質）和獵物（可以與誘餌蛋白質相互作用的蛋白質）來實現這一目的，以了六合彩算法解它們在人類DNA修復和酵母染色質重塑複合物中是如何相互作用的。通過TopS，以並行方式分析數據，這意味著可以同時考慮來自多個妞妞鐵支與生物相關的誘餌的數據。 TopS的一個關鍵屬性是能夠相對於其他誘餌評估獵物蛋白對誘餌的偏好。 “現在，我們不再只通過集中單個誘餌的信息來計算得分，而是從整個數據集中匯總信息，” Sardiu解釋說。
Washburn和Sardiu認為，TopS可以應用於蛋白質組學以外的廣泛數據集，包括基礎研究和其他領域。她說，Sardiu看到了將其用於醫療保健數據的潛力，在那裡醫生可能能夠將患者的健康狀況與其他人進行比較，例如能夠判斷患者的疾病是否“相對於其他人而言確實處於晚期”。
該團隊還將這些發現發佈在計算機代碼存儲庫Github上，因為他們希望為其他研究人員提供機會來測試算法，並研究如何將其應用於自己的項目。
“我們很高興看到它能走多遠。這是一個潛在的高影響力工具，我們想看看還有哪些其他創意和創新94大發網-娛樂城推薦積極的人可以提出來。” “我們認為，對於許多人來說，這是一個非常有價值的潛在工具，他們面臨著處理超大型數據的挑戰。”
本文已從Stowers醫學研究所提供的材料中重新發表。注意：materi王者娛樂城可能已對其長度和內容進行了編輯。有關更多信息，請聯繫引用的來源。
參考：Mihaela E.Sardiu，Joshua M.Gilmore，Brad D.Groppe，Arnob Dutta，Laurence Florenshoya娛樂城 和Michael P. Washburn。 2019.蛋白質相互作用網絡的拓撲評分。自然通訊。 DOI：https：//doi.org/10.1038/s41467-019-09123-y。
