全球基因組信息學和數據管理的領導者DNAnexus今天宣布其與佐治亞大學的Dawe實驗室,愛荷華州立大學的Hufford實驗室以及冷泉港實驗室和美國農業部(USDA)的Ware實驗室的合作細節。 ),以成功完成玉米種群的從頭基因組組裝,其中涉及在美國發現的26個品種。 DNAnexus提供了一項交鑰匙服務,克服了玉米基因組的複雜性和可擴展性的需求所帶來的挑戰,裝配時間減少了350倍,參考基因組質量的連續性提高了10倍。
這項合作意義重大,因為到本世紀末它已成為淘金娛樂城ed將有超過110億人居住在這個星球上。氣候變化的影響以及人口的增長,都需要對農業進行遺傳改良,這與人類健康中的精準醫學類似。玉米是按產量計算的世界上最重要的穀物,使其成為支持生長的特別重要的作今彩539包牌6碼中獎金額物帝禾娛樂城g全球需求。
“我們利用DNAnexus及其xVantage小組來幫助我們完成玉米的種群級基因組裝配,” USDA ARS科學家兼兼職教授,冷泉港實驗室的Doreen Ware博士說。 “該團隊確實為我們推動了前沿,使我們能夠擴展和優化這個特別複雜的基因組,並利用多種技術來提供異常高質量的參考組裝。利用對玉米基因組的新知識,研究人員可以進一步提高玉米產量,營養含量以及植物對氣候變化,病蟲害和疾病的負面影響的抵抗力。”
玉米的基因組組裝特別複雜,因為該植物的重複和轉座因子不斷變化。玉米基因組的大小與人類基因組相似,三分之二由重複區域組成,這需要大量的計算資源才能進行準確的從頭組裝。利用Microsoft Azure上的DNAnexus,此次合作中使用了多種測序和組裝技術,包括PacBio SMRT長讀取技術,Illumina短讀取和BioNano光學繪圖。
金好贏娛樂城DNAnexus首席執行官Richard Daly說:“這個玉米組裝項目是如何使用DNAnexus加速科學發現的有力例子。” “下一次綠色革命將由數據驅動。我們為六合彩全車成為全球基因組組裝服務的領先提供商而感到自豪。”
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玉米大會的數據地下539包牌將在2019年1月12日至16日在加利福尼亞州聖地亞哥舉行的國際動植物基因組會議上發表