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ChIP-Seq可能全部量化了A新娛樂城體驗金long

十多年來,科學家研究 娛樂城註冊送現金表觀遺傳學已經使用一種稱為ChIP-seq的強大方法來繪製整個基因組中蛋白質和其他關鍵調控因子的變化圖。儘管ChIP-seq提供了有關健康和疾病基礎的寶貴見解,但它也面臨著一個令人沮喪的挑戰:其結果通常被視為定性而不是定量的,因此難以解釋。

但是事實證明,ChIP-seq m註冊送彩金根據最近的一份報告被選為“編輯精選”並刊登在 生物化學雜誌.

“ ChIP-seq是表觀遺傳學研究的骨幹淘金娛樂城rch。我們的發現挑戰了人們的信念,即需要定量分析才能採取其他措施。”Van A的研究人員Brad Dickson博士說。大老爺娛樂城恩德爾研究所及其研究的通訊作者。 “我們的新方法提供了一種量化結果的方法,從而使ChIP-seq更加精確,同時不影響標準協議。”

先前定量ChIP-seq結果的嘗試已導致在協議中添加了其他步驟,包括使用“尖峰插入”,這是旨在標準化ChIP-seq結果並揭示原本可能被掩蓋的組蛋白變化的添加劑。這些額外的步驟增加了實驗的複雜性,同時還增加了可能會影響重現性的變量。重要的是,該研究還確定了以前未討論過的尖峰歸一化中的敏感性問題。

Dickson及其同事使用預測性物理模型開發了一種稱為sans-spike-in方法的定量ChIP測序(siQ-ChIP)新方法。它使研究人員可以遵循標準的ChIP-seq協議,從而無需加標,並且概述了所有ChIP-seq實驗都應報告的一組通用測量值,以確保可重複性和定量。

通過在免疫沉澱步驟利用結合反應,siQ-ChIP定義了測序結果的物理量表,可以在實驗之間進行比較。的 94大發網-娛樂城推薦定量規模基於免疫沉澱產物的結合等溫線。

參考:Dickson BM,Tiedemann RL,Chomiak AA,Cornett EM,Vaughan RM,Rothbart SB。定量ChIP測序的物理基礎。 生物化學雜誌2020; 295(47):15826-15837。 doi:10.1074 / jbc.RA120.015353。

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