研究人員已經啟動了一個超大型的虛擬對接庫,預計到明年將增長到超過10億個分子。這種“按需製造”化合物的數量將增加1000倍,科學家可以輕鬆地將其用於化學生物學和藥物發現。庫越大,清除非活性“誘餌”分子的可能性就越大,否則該分子可能導致研究人員走入盲巷。該項目由國立衛生研究院資助。
美國國立衛生研究院國家精神衛生研究所(NIMH)主任Joshua A. Gordon醫學博士解釋說:“為了改善用於精神疾病的藥物,我們需要篩選大量潛在的治療分子。”研究。 “無偏的計算模型使我們能夠在計算機上進行此操作,從而極大地加快了發現新療法的過程。它使研究人員實際上可以“看到”一個與其受體蛋白對接的分子(例如港口泊位中的船或鎖中的鑰匙),並根據預測的分子結構相互作用來預測其藥理特性。只有那些與計算機目標輪廓最匹配的相對較少的候選分子才需要在濕實驗室中進行物理製造和測試。”
北卡羅萊納大學(UNC)教堂山分校的布萊恩·羅斯(Bryan Roth)博士,加利福尼亞大學舊金山分校的布萊恩·肖奇(Brian Shoichet)博士和約翰·歐文(John Irwin)博士及其同事在2019年2月6日的《自然》雜誌上報告他們的發現。這項研究部分得到了NIMH,美國國立普通醫學科學研究所(NIGMS),NIH共同基金和美國國家神經疾病與中風研究所(NINDS)的資助。
美國國立衛生研究院共同基金的“啟發可藥用基因組(IDG)計劃”於2014年啟動,旨在促進對目前尚未被研究的蛋白質和治療干預目標的研究,從而為擴展塢庫提供了資金。
在過去的幾年中,Roth,Shoichet及其同事採用了基於虛擬結構的對接方法來發現抗精神病藥和LSD分撲克牌妞妞作弊子對接的分子秘密,並將其對接在各自的目標受體中。並設計出一種止痛藥,可以選擇性地針對腦部止電競運彩下注痛電路而不會產生嗎啡的副作用。
已知存在數量驚人的潛在藥物樣分子。然而,由於以下因素的限制,數億至數十億種多樣的分子仍然無法獲得娛樂城評價 研究人員說,現有的用於編譯分子庫的方法。例如,他們基於虛擬結構的對接技術雖然很有希望,但有發現許多假陽性或“誘餌”的風險-模型中的缺陷使分子看起來看似合理,但實際上卻沒有生物學活性。
為了克服這一挑戰,研究人員專注於由新天下娛樂城 130,000個特徵明確的化學反應,使用70,000種不同的化學構建基塊。用這些分子進行的計算機模擬表明,隨著文庫大小的增加,“真實活性物質”與誘餌的比率娛樂城廣告的增加-就像研究的統計能力隨著樣本量的增加而增加一樣。
在這項新研究中,研究人員研究了1.38億個分子與D4受體的結構對接,D4受體是介導大腦化學信使多巴胺或賦予AmpC酶作用的關鍵蛋白,AmpC對某些抗生素具有抗性並具有事實證明很難阻止。
NIMH神經科學和醫學系主任Laurie Nadler博士說:“ D4受體對於NIMH尤為重要,因為它在大腦前額葉皮層的認知和其他執行功能中經常發揮作用,而這些功能通常在精神疾病中受到干擾。”基礎行為科學,計劃官員,支持D4受體研究2019娛樂城推薦.
然後,研究人員在實驗室中合成並測試了實際上與D4受體最緊密結合的前549個分子和與酶最緊密結合的44個分子。這些研究揭示了幾種新穎的類藥物分子,它們僅與D4受體結合(而不與緊密相關的D2或D3多巴胺受體結合)並打開或關閉該受體。此外,一個分子(4163)出現了信用卡娛樂城是AmpC捕 魚 達人-大型 機 台 打 魚 完美移植有史以來最強大的粘合劑。虛擬分子的對接秩預測了在實驗室分析中其與D4多巴胺受體結合的實際可能性。
對於兩個靶標均發現了新的有效分子,這也證實了超大型文庫包含的分子比較小的文庫更適合給定受體結構的分子,並且虛擬對接可以識別分子並預測文庫中預期的活性化合物的總數。
戈登補充說:“這項新研究表明了無偏見的計算篩选和分子對接發現新工具分子和潛在治療劑的潛力,提供了一種快速而穩健的途徑,將直接導致針對精神疾病的新型藥物治療。”
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